انتقال هدفمند دارو / دارورسانی هوشمند
وحید خندان؛ بهار فیروزآبادی؛ محمدسعید سعیدی
دوره 8، شماره 3 ، مهر 1393، ، صفحه 229-239
چکیده
مطابق نظریهی آمیلویید، علّت آسیب دیدن سلولهای عصبی سیستم اعصاب مرکزی در بیماران آلزایمری، تجمّع و تشکیل تودههای پروتیین آمیلوییدبتا است. بدین منوال، تجزیهی صفحههای بتا در مرحلهی ابتدایی این فرایند به عنوان یک روش درمان مناسب برای این بیماری پیشنهاد میشود. دارویی که درین تحقیق مطابق همین هدف استفاده شده، پنج پپتید ...
بیشتر
مطابق نظریهی آمیلویید، علّت آسیب دیدن سلولهای عصبی سیستم اعصاب مرکزی در بیماران آلزایمری، تجمّع و تشکیل تودههای پروتیین آمیلوییدبتا است. بدین منوال، تجزیهی صفحههای بتا در مرحلهی ابتدایی این فرایند به عنوان یک روش درمان مناسب برای این بیماری پیشنهاد میشود. دارویی که درین تحقیق مطابق همین هدف استفاده شده، پنج پپتید جداشده از پایانهی کربوکسیل آمیلوییدبتا با توالی گلیسین، لوسین، متیونین، والین و گلیسین است که اثر آن بر یک منومر جدا شده از صفحهی بتای توسعه یافته به عنوان گیرنده، به روش شبیهسازی ترکیبی داکینگ و دینامیک مولکولی مورد مطالعه قرار گرفت. نتایج این شبیهسازی نشان میدهد که دارو با اتصال به منومر پروتیین آمیلوییدبتا در یک محل پیوند پایدار، ساختار ثانویهی آن را تغییر داده و با حذف عوامل پایدار کنندهی ساختار منومر، فرایند تشکیل صفحههای بتا را در جهت عکس مسیر پیشرفت بیماری سوق میدهد. پنتاپپتاید به عنوان یک ناپایدار کنندهی صفحههای تجمّع یافتهی بتا از پروتیین آمیلوییدبتا معرفی شد. این دارو، میتواند در مراحل دیگر روند طراحی آن مورد بررسی قرار گیرد.
مدلسازی رایانهای زیستی / شبیهسازی رایانهای زیستی
حسین قاسمی؛ محمدسعید سعیدی؛ بهار فیروزآبادی
دوره 7، شماره 3 ، آذر 1392، ، صفحه 255-264
چکیده
ساختار مجاری هوایی دستگاه تنفسی انسان پیچیده و در عین حال کاملاً متغیر است. بسیاری از مواد درمانی که به منظور درمان بیماریهای ریوی استفاده میشوند، بصورت ذرات ائروسل وارد مجاری هوایی ریه میشوند. چنین فرایند درمانی نیازمند حرکت و جذب ذرات در نواحی مشخصی از ریه است. در مطالعه حاضر، مدل شامل سه نسل اول از مجاری هوایی هدایتی دستگاه ...
بیشتر
ساختار مجاری هوایی دستگاه تنفسی انسان پیچیده و در عین حال کاملاً متغیر است. بسیاری از مواد درمانی که به منظور درمان بیماریهای ریوی استفاده میشوند، بصورت ذرات ائروسل وارد مجاری هوایی ریه میشوند. چنین فرایند درمانی نیازمند حرکت و جذب ذرات در نواحی مشخصی از ریه است. در مطالعه حاضر، مدل شامل سه نسل اول از مجاری هوایی هدایتی دستگاه تنفسی انسان بر اساس اطلاعات مدل هورسفیلد، ساخته شده است. با استفاده از روش تولید شبکه ساختاریافته برای مدلهای پیچیده، به منظور افزایش دقت و کاهش هزینههای محاسباتی، برای این مدل -که مدلی نامتقارن و پیچیده است- شبکه ساختاریافته تولید شد. جریان آرام و سهبعدی به ازای دبی lit/s0.18 و lit/s0.41 در ورودی مدل مطالعه شد. این محدوده دبی به منظور آرام ماندن جریان انتخاب شد که مربوط به حالت استراحت تا فعالیت سبک انسان است. الگوی سرعت یکنواخت در حالت پایا شرط مرزی ورودی مسأله است. توزیع ذرات بر اساس الگوی سرعت اولیه ورودی با تعداد ذرات 18000 عدد استفاده شده است. به منظور مطالعه حرکت و جذب ذرات از عدد بی بعد استوکس استفاده شد. مسأله برای رینولدزهای 800، 1201، 1486 و 1800 و در اعداد استوکس مختلف 0.025، 0.051، 0.076 و 0.102 حل شد. به منظور کاهش آثار شرط مرزی بالادست و پاییندست، مطالعه برای نسل دوم مجاری انجام شد. برای حل میدان جریان از نرمافزار فلوئنت و برای ردیابی ذرات از کد ردیاب نوشته شده، استفاده شد. در نهایت رابطهای برای راندمان کلی جذب ذرات در نسل دوم مجاری بر اساس اعداد بی بعد رینولدز و استوکس به دست آمد.
الگوبرداری زیستی / زیستتقلیدی
محمدرضا نیک منشی؛ بهار فیروزآبادی؛ محمدسعید سعیدی
دوره 7، شماره 2 ، شهریور 1392، ، صفحه 97-105
چکیده
ناحیه جلویی سلول تحت عنوان لملیپودیال به دو قسمت ب هنام های لملوم و لملیپودیوم، تقسیم بندی می شود. جریان های داخلی موجود در این ناحیه، نقشی اساسی در حرکات بیرونی سلولی ایفا م یکنند. در واقع، تعداد بسیار زیادی رشته های پروتئینی به نام اکتین در لملوم و لملیپودیوم سلول وجود دارد، که با پلیمرایز شدن در لبه جلویی سلول، موجب پیشروی آن می ...
بیشتر
ناحیه جلویی سلول تحت عنوان لملیپودیال به دو قسمت ب هنام های لملوم و لملیپودیوم، تقسیم بندی می شود. جریان های داخلی موجود در این ناحیه، نقشی اساسی در حرکات بیرونی سلولی ایفا م یکنند. در واقع، تعداد بسیار زیادی رشته های پروتئینی به نام اکتین در لملوم و لملیپودیوم سلول وجود دارد، که با پلیمرایز شدن در لبه جلویی سلول، موجب پیشروی آن می شوند. رشته های اکتینی توسط نواحی چسبندگی به محیط بیرونی سلول متصل شده و با آن در ارتباط هستند. المان دیگری که با شبکه رشته ای اکتین در ارتباط است، موتور پروتئی نهای مایسین می باشند که در دینامیک این شبکه نقشی اساسی برعهده دارند. در واقع، مایسی نها با اعمال تنش های کششی بر رشت ههای اکتینی آ نها را تحت تأثیر قرار داده و موجب ایجاد جریا نهای عق بروند و جل ورونده شبکه اکتینی در داخل سلول می گردند. در مقاله حاضر، ما مدلی دوبعدی از ناحیه جلویی یک سلول با سرعت بالا، که پوست ماهی را تشکیل داده و هندسه ای بادبزنی شکل دارد (سلول کراتوسیت)، برای بررسی الگوی جریان اکتینی، در نظر گرفت هایم. در این مدل، شبکه اکتینی به عنوان یک سیال نیوتنی فرض شده است. ما همچنین، تأثیر موتور پروتئین های مایسین و سرعت پیشروی سلول را بر جریان اکتین مورد بررسی قرار داده ایم. به طور کلی، نتایج حاضر شامل الگوی جریان اکتین و توزیع مایسین درون سلول متحرک و مشخص نمودن رابطه بین آن ها است. این نتایج، با داده های آزمایشگاهی گزارش شده و نتایج عددی دیگر، کاملاً مطابقت داشته و مورد مقایسه قرار گرفته اند.
بیومکانیک قلب و عروق
مهدی مولائی؛ محمدسعید سعیدی؛ بهار فیروزآبادی
دوره 5، شماره 4 ، اسفند 1390، ، صفحه 279-288
چکیده
به علت نقش اساسی دستگاه گردش خون در بدن و گسترش روزافزون بیماریهای مربوط به آن در کار حاضر سعی شده است تا با استفاده از شبیهسازی عددی یکبعدی، سیستم سرخرگهای اصلی دستگاه گردش خون مدل شود. برای اولین بار در شبیهسازی یکبعدی از روش حجم محدود برای گسستهسازی معادلات ناویراستوکس که با معادله حالت کوپل شده استفاده شده است. در ...
بیشتر
به علت نقش اساسی دستگاه گردش خون در بدن و گسترش روزافزون بیماریهای مربوط به آن در کار حاضر سعی شده است تا با استفاده از شبیهسازی عددی یکبعدی، سیستم سرخرگهای اصلی دستگاه گردش خون مدل شود. برای اولین بار در شبیهسازی یکبعدی از روش حجم محدود برای گسستهسازی معادلات ناویراستوکس که با معادله حالت کوپل شده استفاده شده است. در گسترش شرایط مرزی خروجی از مدلی موسوم به درختچهی شریانی ساختار یافته بهره گرفته شده است و مدل یکبعدی با مدل متمرکز ( لامپ) کوپل شده است. نتایج این حل، با سایر حلهای یکبعدی چون روش مشخصهها اعتبارسنجی شده و نشان داده شده که استفاده از روش حجم محدود نیز میتواند مشخصات جریان خون در سرخرگها را به خوبی نشان دهد. همچنین پروفیلهای فشار و دبی در رگهای اصلی بدن در حالت نرمال به دست آمده و نشان داده شده که با دور شدن از قلب پروفیل فشار تیزتر میشود که با نتایج فیزیولوژیک همخوانی دارد. همچنین نشان داده میشود که با افزایش ضریب الاستیک رگها در بیماری تصلب شریان، فشار سیستولی افزایش و همراه با آن فشار دیاستولی کاهش مییابد. در نهایت با توجه به نتایج به دست آمده این نکته به دست میآید که روش حجم محدود کارایی لازم برای شبیهسازی عددی یکبعدی دستگاه گردش خون را دارا میباشد.