نوع مقاله : مقاله کامل پژوهشی
نویسندگان
1 دانشجو کارشناسی ارشد، دانشکده مهندسی مکانیک، دانشگاه صنعتی شریف، تهران
2 استاد، دانشکده مهندسی مکانیک، دانشگاه صنعتی شریف، تهران
چکیده
مطابق نظریهی آمیلویید، علّت آسیب دیدن سلولهای عصبی سیستم اعصاب مرکزی در بیماران آلزایمری، تجمّع و تشکیل تودههای پروتیین آمیلوییدبتا است. بدین منوال، تجزیهی صفحههای بتا در مرحلهی ابتدایی این فرایند به عنوان یک روش درمان مناسب برای این بیماری پیشنهاد میشود. دارویی که درین تحقیق مطابق همین هدف استفاده شده، پنج پپتید جداشده از پایانهی کربوکسیل آمیلوییدبتا با توالی گلیسین، لوسین، متیونین، والین و گلیسین است که اثر آن بر یک منومر جدا شده از صفحهی بتای توسعه یافته به عنوان گیرنده، به روش شبیهسازی ترکیبی داکینگ و دینامیک مولکولی مورد مطالعه قرار گرفت. نتایج این شبیهسازی نشان میدهد که دارو با اتصال به منومر پروتیین آمیلوییدبتا در یک محل پیوند پایدار، ساختار ثانویهی آن را تغییر داده و با حذف عوامل پایدار کنندهی ساختار منومر، فرایند تشکیل صفحههای بتا را در جهت عکس مسیر پیشرفت بیماری سوق میدهد. پنتاپپتاید به عنوان یک ناپایدار کنندهی صفحههای تجمّع یافتهی بتا از پروتیین آمیلوییدبتا معرفی شد. این دارو، میتواند در مراحل دیگر روند طراحی آن مورد بررسی قرار گیرد.
کلیدواژهها
موضوعات
عنوان مقاله [English]
Simulation of Pentapeptide Drug Interaction with β-Sheet-Rich Monomers of Aβ Protein for Alzheimer Treatment
نویسندگان [English]
- Vahid Khandan 1
- Bahar Firoozabadi 2
- Mohammad Saeid Saeidi 2
1 M.Sc Student, Mechanical Engineering Department, Sharif University oh Technology
2 Professor, Mechanical Engineering Department, Sharif University oh Technology
چکیده [English]
A hallmark of Alzheimer disease (the most common type of dementia in the elderly) is the aggregation and deposition of toxic species ranging from small soluble oligomers to insoluble fibril plaques of Amyloid-Beta protein originates from the cleavage of APP by Beta and Gama Secretase (Amyloid Hypothesis). An attractive therapeutic approach to treat AD is to identify small ligands capable of binding to A-Beta monomers and reverse its amyloidosis process. Here, a peptide drug having the sequence of GLMVG which has been derived from the C-terminal of A-Beta was used as breaker for a monomer of Beta sheet rich structure. The combination of Docking and Molecular Dynamics methods were used for simulation of drug-receptor interaction. This simulation implied that pentapeptide altered secondary structure of A-Beta monomer and declined its stability. This study proved that pentapeptide is capable to reverse Beta-sheet formation and can be considered as an AD drug in other preclinical studies.
کلیدواژهها [English]
- Alzheimer’s disease (AD)
- Amyloid Beta (Aβ)
- β-Sheet Breaker
- docking
- Molecular dynamics (MD)