به‌کارگیری یادگیری منیفلد برای تحلیل تصاویر اکوکاردیوگرافی

گیفانی, پریسا; بهنام, حمید; علیزاده ثانی, زهرا

doi:10.22041/ijbme.2010.13335

نوع مقاله : مقاله کامل پژوهشی

نویسندگان

¹ کارشناس ارشد، آزمایشگاه پردازش تصاویر پزشکی، دانشکده مهندسی برق، دانشگاه علم و صنعت ایران

² استادیار، دانشکده مهندسی برق، دانشگاه علم و صنعت ایران

³ استادیار، مرکز آموزشی تحقیقاتی و درمانی قلب و عروق شهید رجایی، دانشگاه علوم پزشکی تهران

10.22041/ijbme.2010.13335

چکیده

روش‌های کاهش بُعد غیرخطی، در دهها خیر بار دیگر مورد توجه محافل علمی قرار گرفته‌اند.با تمرکز محققان علم کامپیوتر بر این مسئله، در چند سال اخیر مجموعه‌ای از ابزارها به‌ وجود آمده‌اند که کاربردهای آنها در داده‌کاوی، پردازش تصویر، طبقه‌بندی، تحلیل ونمایاندن دادگان رو به افزایش است.در این میان یادگیری منیفلد ابزاری قدرتمند برای کاهش بعد غیرخطی دادگان است. پارامترهای ذاتی سیستم که عامل اصلی تمایز دادگان از یکدیگرند با استفاده از این ابزار شناسایی شده و کل مجموعه بر روی منیفلدی که بیان‌کننده ارتباط واقعی پارامترهاست، قرار می‌گیرد. بدین ترتیب ارتباط بین دادگان در فضایی با بعد کمتر بیان می‌شود. یکی از کاربردهای موفق این روش‌ها در تحلیل تصاویر است. با این دیدگاه فرض می‌شود هر تصویر داده‌ای در بعد بالا بوده که هر پیکسل یک بعد از فضا را اشغال می‌کند. درصورتی‌که این مجموعه تصاویر از شیئی خاص اخذ شده باشند که براساس پارامترهای کمّی با یکدیگر تفاوت دارند؛ می‌توان با استفاده از ابزارهای مناسب یادگیری منیفلد، این مجموعه تصاویر را در فضایی با بعد کمتر به گونه‌ای نگاشت کرد که ارتباط ذاتی پارامترها حفظ شود.در این تحقیق چگونگی به‌کارگیری این ابزار برای تحلیل مجموعه تصاویر اکوکاردیوگرافی مورد بررسی قرار می‌گیرد. از آنجا که تصاویر اکوکاردیوگرافی اخذ شده از یک بیمار براساس پارامترهای کمّی از جمله حرکت تناوبی قلب و نویز متفاوت هستند، با استفاده از الگوریتم مناسب یادگیری منیفلد، مجموعه تصاویر در فضای دوبعدی فرونشانده می‌شوند و ارتباط بین فریم‌های متوالی در فضای جدید تعیین می‌شود. در این تحقیق با استفاده از دو الگوریتم LLEو ISOMAP، پس از نگاشت چند دوره تناوب تصاویر در فضای دوبعدی، تصاویر مشابه در کنار یکدیگر قرار گرفته و رابطه بین تصاویر بر اساس خاصیت تناوبی ضربان قلب نمایان می‌شود. نتایج حاکی از ضعف الگوریتم ISOMAPو قدرت الگوریتم LLEدر حفظ ارتباط واقعی تصاویر اکوکاردیوگرافی در فضای دوبعدی است. در نهایت، کاهش نویز تصاویر به صورت میانگین‌گیری تصاویر مشابه بر روی منیفلد حاصل از الگوریتم LLEبه عنوان یک کاربرد مفید معرفی می‌شود.

کلیدواژه‌ها

موضوعات

پردازش تصاویر پزشکی

عنوان مقاله [English]

Analysis of Echocardiography Images using Manifold Learning

نویسندگان [English]

Parisa Gifani ¹
Hamid Behnam ²
Zahra Alizadeh Sani ³

¹ M.Sc Graduated, Medical Image Processing Lab., School of Electrical Engineering, Iran University of Science and Technology

² Assistant Professor, School of Electrical Engineering, Iran University of Science and Technology

³ Assistant Professor, Rajaei Cardiovascular Medical and Research Center, Tehran University of Medical Sciences

چکیده [English]

Dimensionality reduction is an important task in machine learning, to simplify data mining, image processing, classification and visualization of high-dimensional data by mitigating undesired properties of high-dimensional spaces. Manifold learning is a relatively new approach to nonlinear dimensionality reduction. Algorithms for manifold learning are based on the intuition that the dimensionality of many data sets may be artificially high and each data point can be described as a function of only a few underlying parameters. Using this tool, intrinsic parameters of the system database, which are main distinction factors of data sets, are recognized and all of them lie on a manifold that shows the real relationship of parameters. One of the successful applications of these methods is in image analysis field. By this approach, each image is a data in high dimensional space that the pixels are its dimensions. Because echocardiography images obtained from a patient are different in quantitative parameters such as heartbeat periodic motion and noise, image sets are reduced to two-dimensional space by a proper manifold learning. In this article, after mapping echocardiography images in two-dimensional space, by using LLE and Isomap algorithms, similar images placed side by side and the relationships between the images according to the cyclic property of heartbeat became evident. The Results showed the weakness of Isomap algorithm and power of LLE algorithm in preserving the relation between consecutive frames. De-noising is an important application which extracted from this research.

کلیدواژه‌ها [English]

Manifold learning
Echocardiography images
LLE
Isomap
de-noising

مراجع

[1] Tenenbaum J.B., Silva V., and Langford J., A global geometric framework for nonlinear dimensionality reduction, Science, 2000; 290: 2319–2323.

[2] Roweis S.T., and Saul L.K., Nonlinear dimensionality reduction by locally linear embedding, Science, 2000; 290:2323-2326.

[3] Saul L. and Roweis S., Think globally, fit locally: unsupervised learning of low dimensional manifolds, Journal of Machine Learning Research., 2003; 4: 119–155.

[4] Hotelling H., Analysis of a complex of statistical variables into principal components. Journal of Educational Psychology, 1933; 24: 417–441.

[5] Cox T. and Cox M., Multidimensional scaling. Chapman & Hall, 1994.

[6] Lafon S. and Lee A..B., Diffusion maps and coarse-graining: A unified framework for dimensionality reduction, graph partitioning, and data set parameterization. IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence, 2006; 28(9): 1393–1403.

[7] Belkin M. and Niyogi P., Laplacian Eigenmaps and Spectral Techniques for Embedding and Clustering, Neural Information Processing Systems, 2002; 14: 585-591.

[8] Donoho D.L. and Grimes C., Hessian eigenmaps: New locally linear embedding techniques for high-dimensional data, Proceedings of the National Academy of Sciences, 2005; 102 (21): 7426–7431.

[9] Dixon M., acobs N.J. and Pless R., Finding Minimal Parameterizations of Cylindrical Image Manifolds, IEEE transaction on Computer Vision and pattern recognition, 2006; 7: 192-200.

[10] Zhang Q., Souvenir R. and Pless R., Segmentation Informed by Manifold Learning, Lecture Notes in Computer Science(LNCS), Springer, 2005; 3757:398-413.

[11] Souvenir R., Pless R., Image distance functions for manifold learning, Image and Vision Computing, 2007; 25(3): 365-373.

[12] Kumar V., Grama A., Gupta A., Karypis G., Introduction to Parallel Computing: Design and Analysis of Algorithms, 1994: 257-297.

[13] Gifani, P., Behnam, H., Shalbaf, A., and Sani, Z. A., Automatic detection of end-diastole and end-systole from echocardiography images using manifold learning, Physiol. Meas, 2010; 31: 1091–1103.

[14] Goodman J. W., Some fundamental properties of speckle, J. Opt. Soc. Amer, 1976; 66: 1145-1150.

[15] Loupas T., McDicken W., and Allan P., An adaptive weighted median filter for speckle suppression in medical ultrasonic images, IEEE Transactions on Circuits and Systems, 1989; 36: 129–135.

[16] Jain A. K., Fundamental of Digital Image Processing. NJ: Prentice-Hall, 1989.

[17] Frost V. S, Stiles J. A., Shanmugan K. S, and Holtzman J. C., A model for radar images and its application to adaptive digital filtering of multiplicative noise, IEEE Trans. Pattern Anal. Machine Intell., 1982;4: 157–165.

نشریه‌ی علمی مهندسی پزشکی زیستی

به‌کارگیری یادگیری منیفلد برای تحلیل تصاویر اکوکاردیوگرافی

مراجع

مراجع

دوره 4، شماره 2 - شماره پیاپی 2
شهریور 1389
صفحه 149-160

به‌کارگیری یادگیری منیفلد برای تحلیل تصاویر اکوکاردیوگرافی

مراجع

مراجع

دوره 4، شماره 2 - شماره پیاپی 2شهریور 1389صفحه 149-160

دوره 4، شماره 2 - شماره پیاپی 2
شهریور 1389
صفحه 149-160